２０１６年、日本の最西端・与那国島の沖合に浮かぶ完成間近の海上情報都市「オーシャンテクノポリス」は謎の波動物体に直撃され、突如海の藻屑と化した。都市を支える１万本の巨大な脚柱が脆くも崩れ去る衝撃は、近海で操業中の海底油田採掘基地「うみがめ２００」と海底牧場を遊覧中の観光用潜水艇をも巻き込み、危機に瀕した油田基地と娘の救出を試みる、倉瀬厚志の苦闘が始まった。