地震学者・仲代寿郎の一家が自宅から忽然と消えた。近日中に関東地方を直下型大地震が襲うと仲代から聞かされていた新聞記者・泊大介が、一家の行方を追うが、不審な死を遂げてしまう。泊の友人、神奈川県警警部・紫水風太郎は、桜道継警視監の許可を得て極秘捜査に乗り出し、事件の背後に新興宗教・天下心霊教と建設会社・丸十建設の暗躍を見る。一方、仲代の息子・鶴男が静岡で無事保護され、仲代夫妻は岡山に移動させられたことが判明。夫妻の救出に岡山へ向かった桜らは、泊殺害の真相とともに事件全体にはびこる謀略の構図を暴く。