龍野・圓光寺の道場で兵法修行をする宮本武蔵は、剣の腕を磨くために参戦した伏見城攻めの最中、手負いの仲間を抱えた３人の忍びと出会う。共に黒田家に仕えることとなった武蔵たちは、京の剣の名門・吉岡家や彼らに襲いかかる柳生一門、伊賀の忍びとの戦いに臨んでいくー。