オメガの五色はまだ人生で一度も発情期がきていない。このまま一生自分は発情しないだろう。そう思っていた矢先、軍人・黒瀬と出会い、初めての発情が起きてしまう。黒瀬はオメガの発情を自由に操れる『Ｓアルファ』という特別な存在らしい。発情してしまったのは黒瀬の特別な性質のせい…？初めての体験に困惑する五色。しかも、五色は軍の探していた『Ｓオメガ』であるという。そのことを知った黒瀬はなぜか軍には報告せず、自らの屋敷で五色を匿う。一緒に暮らすうちに互いに惹かれていく二人。だが、五色のことが軍にバレてー！？