水の汚染がすすむ琵琶湖。あつこは、環境保護運動にいっしょうけんめいな、おかあさんが、ちょっぴりきらいだ。そんなあつこのクラスで、水生生物調査隊ができた。いよいよ、先生や市役所の人のおかげで、あつこたちは、みずすまし一世号に乗って、琵琶湖の水の調査にでかけるが…。