わたしは、松田コロン。ふつうの小学校なら六年生、わが「私立探検家学園」では二回生。ドラゴンの卵を探せだの、マンドラゴラを見つけろだの、耳をうたがう“実習”を乗りきって、むかえた新学年。同級生たちとはじめた「ランニング部」も、体力づくりとは名ばかりで、この学園のひみつにせまるため！そんな、わたしたちを待ち受ける、三度目の“実習”。ミッションは、「メガクリスタルを見つけだせ！」