戦乱の世を徳川家康の手足となって活躍してきた忍者集団服部家の家名が断絶された。かねてより不肖の噂のあった２代目半蔵を家康が見限ったのだと言うものもあったが、何よりも、関ヶ原以後の平静を取戻した世の中に忍者が不必要になったのだと誰もが思った。ところが、それは世間の目を晦ます策略であった。廃屋となった半蔵屋敷の地下では、大阪方をゆさぶるべく太閤の遺臣達の暗殺計画が着々と練られていた。家康の野望を実現するため闇に潜行した伊賀忍者と、あくまで豊臣秀頼を守り抜こうとする戸隠忍者の忍法、死を賭した戦い。歴史の裏を駆ける男たちを描く時代巨編。