人工生命、錬金術、永久機関…、歴史の闇から甦った超科学を破壊・封印する闇の狩人、姫城玲。決して歴史の表舞台には姿を現さず、闇の世界に咲き誇る狂科学の砦『黄金の薔薇』に変化が起こりつつあった。突如日本に現れた最高幹部リビティナ女大公は日本政府への干渉を公然と行い、白昼の銀座を戦場に変えた。次第に追い詰められていく玲たち。そしてリビティナがその正体を表したとき、恐るべき危機が訪れる。