再び時空を超え、厳寒のベーリング海の氷に閉ざされてしまった自衛艦『やまと』を救出したのは、ソ連極東海軍だった。日ソ中立条約が結ばれているとはいえ何故ソ連海軍が？アリューシャン列島ダッチハーバーに集結する連合艦隊に合流した『やまと』の艦長・笹田は山本五十六長官から驚愕の事実を告げられる。日本の進撃によって米国が劣勢になったのを見たソ連はドイツと休戦、枢軸側に寝返ったのだ。日ソ両軍は氷結したベーリング海峡を渡り、アラスカ・カナダを経由してシアトルに侵攻した。一方、英国を占領したドイツは大西洋に進出、ここに日独ソ三国による合衆国挟撃作戦が動き出したのだ。窮地に追い込まれた米国は自国内での原爆実戦投入とブラックホール（ＢＨ）兵器の開発継続を決断、逆転を狙うが…。