米第５艦隊司令長官スプルーアンスは、日本軍が秘匿する巨大空母の正体を暴くべく、ミッドウェーに進出した。島を奪還すると見せかけて謎の空母をおびき出し、その全貌を明らかにしようという作戦だった。昭和十八年十月、日米艦隊は再びミッドウェーで激突した。連合艦隊は小沢機動部隊と大西中将麾下の「潜龍」の先制攻撃によって敵空母を殲滅。米機動部隊の漸減に成功するが、その代償は大きかった。小沢艦隊は正規空母二隻を喪失、「潜龍」戦闘機隊も山内直人上飛曹の盟友里崎ら多数が未帰還となってしまう。しかも「潜龍」の正体が潜水空母であることをついに米軍に知られてしまったのだ。戦力が大幅に減衰するなか、連合艦隊は太平洋艦隊のマーシャル進出を阻止するためメジュロ泊地奇襲作戦を発動。だが、出撃した「潜龍」を待ち受けていたのは、敵駆逐艦による爆雷攻撃の嵐だった！大好評戦記シリーズ完結編。